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[[Ｒ備忘録 - 記事一覧]]

!!!JavaからRserveを使う
*投稿者： みゅ
*カテゴリ： なし
*優先度： 普通
*状態： 完了
*日時： 2008年12月04日 22時20分09秒
//{{bugstate}}
!!内容
JavaからRを操作する．そのときにRserveを介する方法．
!!!Rserveとは
 Rserve is a TCP/IP server which allows other programs to use facilities of R
 from various languages without the need to initialize R or link against R library. 
*リンク
**http://www.rforge.net/Rserve/
***http://rosuda.org/Rserve/
!!ダウンロード
*RおよびRserveはLinux版を今回は使用
*投稿時点での最新版「Rserve_0.3-17.tar.gz」をhttp://rosuda.org/Rserve/down.shtmlからダウンロード
!!インストール
*コマンドラインから
 $ R CMD INSTALL Rserve_0.3-17.tar.gz
!!設定ファイルの記述
*Rserveはデフォルトではリモート接続は拒否するようになっているみたいです．「/etc/Rserv.conf」が設定ファイルですので（なければ自分で作成、というか最初はないと思う）
  remote enable
*を書き込んで、保存しましょう．その他、設定ファイルの書き方は「http://rosuda.org/Rserve/doc.shtml#conf」を、ご参照
!!Rserveの起動
 $ R CMD Rserve
*Rをデーモンモードで起動したよ的なメッセージが出る
*psコマンドでもRserveが動いているかどうか確認してみましょう
!!Rserveの停止
*定型的な方法がわかりません
*いつも「kill -9 プロセス番号」でkillしています．
!!!Javaの準備
*Windoows上でEclipseから使ってみることにします．
!!Javaのクライアント用クラスのダウンロード
*Rserveの[ダウンロードのページ|http://rosuda.org/Rserve/down.shtml]の【Java client】から「JRclient-RF503.jar」か「JRclient-RF503.tar.gz」をダウンロード．みゅはtarのほうをダウンロード
*解凍すると
{{ref_image Rserve_gazo1.png}}
*こんな感じになります．
!!Eclipseへの登録
*適当なプロジェクトを作成します
**みゅの環境では「JRclient」
**「examples」はここでは使いません．
*ソースを以下のように配置します．このとおりでなくてもいいです．エラーが出ていなければ．
{{ref_image Rserve_gazo2.png}}
*これで準備は完了
!!!Javaのクライアント用ソースコードを書く
*さっき作ったRserveクライアント用クラスがあるプロジェクトに作ってもいいですが、みゅは別プロジェクトにしました．「JRclientExamples」プロジェクトです．
!!プロジェクト参照
*このプロジェクトがさっき作った「JRclient」を参照できるようにします．追加ボタンから追加します．
{{ref_image Rserve_gazo6.png}}
!!例①
*書くって言いましたけど、とりあえずさっき使わなかった「examples」フォルダのサンプルコードを使います．
*「examples」フォルダにある「tt.java」を適当なパッケージに配置します．
{{ref_image Rserve_gazo3.png}}
*「tt.java」の１０行目あたりにある
 Rconnection c = new Rconnection((arg.length>0)?arg[0]:"127.0.0.1"); // make new connecton
*を、変更します．
*「127.0.0.1」が接続先のRserveが動いているサーバーのIPアドレスです．サーバーの名前でも設定できます．
 Rconnection c = new Rconnection((arg.length>0)?arg[0]:"サーバー名"); // make new connecton
*のようにするか
 Rconnection c = new Rconnection((arg.length>0)?arg[0]:"192.168.aa.bb"); // make new connecton
*のように（aaとbbは数字、「192.168.aa.bb」はRserveが動いているサーバーのIPアドレス）変更します．
*この「tt.java」を実行します．みゅの環境では
 Server vesion: 102
 creating large data ...
 assigning data ...
 create matrix ...
 retireve matrix ...
 get as matrix ...
 got: [REAL* 
 attr=[LIST [INT* (2048, 1024)] <-> [NULL ]]
 (0.0, 1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0, 6.0, 7.0, 8.0, ・・・99.0, ... (2097052 more values follow))]
 got m(2048,1024)
*のように、コンソールに出力されて、実行が終了します．
*サーバーが見つからない場合には、以下のエラーが出るようです．
 Rserve exception: Cannot connect: No route to host: connect
*サーバーは見つかったけど接続が拒否された場合
 Rserve exception: Cannot connect: Connection refused: connect
!!!例②
*[[例②|BugTrack-Ｒ備忘録/15]]
*[[JavaからRserveを使う③|BugTrack-Ｒ備忘録/21]]
!!コメント
//{{comment}}