//このページが表示される方は、URLから「action=SOURCE&」を削除してみてください
[[Ｒ備忘録 - 記事一覧]]

!!!RODBCでいろんなデータベースと通信する
*投稿者： みゅ
*カテゴリ： なし
*優先度： 普通
*状態： 完了
*日時： 2009年04月22日 08時50分44秒
//{{bugstate}}
!!内容
Rのパッケージ【RODBC】を使ってみる
*というか、実務では使いまくってます．
!!unixODBCのインストール
*RODBCを使うためにはまずunixODBCをインストールする必要がある
**（iODBCでもいいのかもしれない．適当）
*コンフィグ
 ./configure --sysconfdir=/etc --enable-gui=no
**「--sysconfdir」を設定しないと、デフォルトでは「/usr/etc」にodbc.iniとかodbcinst.iniがあると思うらしい．
**実行時に環境変数「ODBCSYSINI=/etc」でもいいらしい．テスト済み．
**「--enable-gui=no」はみゅの環境では「Qtがなくてコンフィグが通らないよ」と怒られたので、つけただけ．
*make
 make
*インストール．rootになって
 make install
!!PostgreSQL
*世界ではSUNがMySQL買収してから、MySQLが大流行なんだそうで．
*そんなこといっても、こっちはPostgreSQLでもう業務まわっちゃってんだもんさ（愚痴）．
*unixODBCでPostgreSQLと通信するためには、以下の２つが必要です
**PostgreSQLのクライアントのインストール
**psqlodbcのインストール
!PostgreSQLのクライアントのインストール
*サーバーのソースにクライアントが入ってるのでサーバーのソースをダウンロード
*普通にコンフィグ
 ./configure
*普通にmake
 make
*rootになってインストール．クライアントだけなので以下で．ソースに含まれる「INSTALL」に書いてある．６８０行目あたり．
 make -C src/bin install
 make -C src/include install
 make -C src/interfaces install
 make -C doc install
!psqlodbc
*コンフィグ
 ./configure
**コンフィグが通らないことがあるかもしれない．エラーメッセージはわすれたけど、longのサイズが取得できないとかなんとか．また出たら更新しよう．
**その場合は「/usr/lib:/usr/local/lib」を「LD_LIBRARY_PATH」に追加するとうまくいくかも．
**ついでに「/usr/local/pgsql/lib」も「LD_LIBRARY_PATH」に追加しておこう．
*make
 make
**makeでもエラーが出ると思う．
**「unixodbcの関数定義と引数が違う」とか怒られるので、psqlodbc側のソースを合うように変更しちゃいます．環境によって怒られる場所は違うと思うけど、以下のような感じ．
 SQLRETURN SQL_API SQLColAttributeW(
         SQLHSTMT        hstmt,
         SQLUSMALLINT    iCol,
         SQLUSMALLINT    iField,
         SQLPOINTER      pCharAttr,
         SQLSMALLINT     cbCharAttrMax,
         SQLSMALLINT     *pcbCharAttr,
 #if defined(WITH_UNIXODBC) || (defined(WIN32) && ! defined(_WIN64))
         /*SQLPOINTER    pNumAttr*/                          ←ここをコメントアウト
         SQLLEN          *pNumAttr                           ←この行を追加
 #else
         SQLLEN          *pNumAttr
 #endif
         )
 {
**家の３２ビット環境だと２箇所、会社の６４ビット環境だと３箇所修正した．
*makeが通ったら、rootになってインストール
 make install
!【/etc/odbcinst.ini】の設定
 [PostgreSQL64]   ①
 Description    = ODBC for PostgreSQL   ②
 Driver         = /usr/local/lib/psqlodbcw.so   ③
 Setup          = /usr/local/lib/libodbcpsqlS.so   ④
 FileUsage      = 1   ⑤
*①は【odbc.ini】で参照する名前．何でもいいけど、わかり易いものをつけましょう．
*②はコメント
*③と④はよくわかんないけどこれで動いてます．
*⑤も不明・・・
*ちなみに上記.soのlddは以下な感じ
 $ ldd /usr/local/lib/psqlodbcw.so
         libpq.so.5 => /usr/local/pgsql/lib/libpq.so.5 (0x00002ae1edddb000)
         libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x00002ae1ee014000)
         libodbcinst.so.1 => /usr/local/lib/libodbcinst.so.1 (0x00002ae1ee22e000)
         libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002ae1ee444000)
         libcrypt.so.1 => /lib64/libcrypt.so.1 (0x00002ae1ee797000)
         /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003ebca00000)
         libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x00002ae1ee9cf000)
 $ ldd /usr/local/lib/libodbcpsqlS.so
         libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x00002b727afaf000)
         libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x00002b727b1c9000)
         /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003ebca00000)
!【/etc/odbc.ini】の設定
 [ZZZ_zzz]   ①
 Description     = PostgreSQL   ②
 Driver          = PostgreSQL64   ③
 Trace           = No
 TraceFile       =
 Database        = aaa   ④
 Servername      = host_name   ⑤
 Username        =
 Password        =
 Port            = 5432
 Protocol        = 6.4
 ReadOnly        = No
 RowVersioning   = No
 ShowSystemTables= No
 ShowOidColumn   = No
 FakeOidIndex    = No
 ConnSettings    =
 UseID           =
*①適当な名前をつけましょう．アプリケーションから参照されます．
*②コメントです
*③「odbcinst.ini」でつけた名前でどのドライバーを使うのかを指定します．
*④postgreSQLの使用するデータベースの名前を指定します．
*⑤サーバーのホスト名です．
*これで動くはずです．
*isqlで確認してみましょう
 isql ZZZ_zzz uid pwd -v
 +---------------------------------------+
 | Connected!                            |
 |                                       |
 | sql-statement                         |
 | help [tablename]                      |
 | quit                                  |
 |                                       |
 +---------------------------------------+
**-vをつけることで、つながらない場合のヒントになるかもしれません．
!R
 library(RODBC)
 cn <- odbcConnect("ZZZ_zzz", "postgreSQLのユーザー名", "パスワード")
*接続完了
!!コメント
//{{comment}}