BugTrack-Ｒ備忘録/23

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rJavaを使ってみる

• 投稿者： みゅ
• カテゴリ： なし
• 優先度： 普通
• 状態： 完了
• 日時： 2009年02月04日 10時52分54秒

内容

• rJavaのサイト http://www.rforge.net/rJava/
• Rはjavaとか使えるように、pathとか通ってないとだめらしい．Gentoo Linuxで動かしてみる．
• Gentooの場合、Ｒがportageにあるので、USEフラグとかに「java」とか書いていると、Rをインストールするまでに、javaとかをインストールしてくれる．

# emerge -pv R

These are the packages that would be merged, in order:

Calculating dependencies... done!
[ebuild   R   ] dev-lang/R-2.7.2  USE="X cairo java jpeg lapack nls png readline
tk -bash-completion -debug -doc -minimal" 0 kB

Total: 1 package (1 reinstall), Size of downloads: 0 kB

• portageのRは上のようにバージョンが古いので、JavaとかXとかの必要なライブラリをインストールするためだけに、「emerge -v R」する．
• で、必要なライブラリとかがこれでインストールされるので、最新のＲをインストールするために「emerge -C R」でこのバージョンのＲをアンインストールする．
• で最新（現時点ではR version 2.8.1 (2008-12-22)）のＲをインストールする．emergeではなく、手動で．

rJavaのインストール

install.packages("rJava")

rJavaのサイトにある、サンプルのテスト

> library(rJava)
> .jinit() # this starts the JVM
> s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!")
> s
[1] "Java-Object{Hello World!}"
> .jcall(s,"I","length")
[1] 12
> .jcall(s,"I","indexOf","World")
[1] 6
> .jmethods(s,"concat")
[1] "public java.lang.String java.lang.String.concat(java.lang.String)"
> .jcall(s,"Ljava/lang/String;","concat",s)
[1] "Hello World!Hello World!"
> print(s)
[1] "Java-Object{Hello World!}"
> .jstrVal(s)
[1] "Hello World!"

• なんと、あっさり動いた！

何に使うか

• Rの並列化を構築中なのですが、pvmとか、mpiとかインストールがめんどくさいし、インストールはうまくいかないし．
• RserveはJAVAのクライアントからも使えている．
• Javaだとスレッドも使える．
• なので、rJavaとRserveとmulticoreを組み合わせることで、クラスター化できないかを、検討中．