BugTrack-Ｒ備忘録/36

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クラスタリング（Hierarchical Clustering）

• 投稿者： みゅ
• カテゴリ： なし
• 優先度： 普通
• 状態： 完了
• 日時： 2009年06月09日 10時45分19秒

内容

• クラスタリング（Hierarchical Clustering）
• hclust(d, method = "complete", members=NULL)

hclust(d, method = "complete", members=NULL)

hca <- hclust(dist(USArrests))
plot(hca)
rect.hclust(hca, k=3, border="red")  //デンドログラムを、グループ化する

別のところで作った相関行列を使ってクラスタリングする

x <- matrix(rnorm(100), nrow=5)  //適当なデータを作る
res_dist <- dist(x)  //distする
attributes(res_dist)  //distの結果のオブジェクトの属性を見てみる
attributes(distVec3) <- attributes(res_dist)  //属性をコピー
attributes(distVec3)$Size <- len_tmp  //Size属性だけが異なるので、変更する
hc3 <- hclust(distVec3)  //クラスタリングをする
plot(hc3)  //描画

• distVec3は、下半分の相関行列
  • 編集距離で作ったベクトル

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